2019新型冠狀病毒，即"SARS-CoV-2 (2019-nCoV)"，基因組依次編碼棘突蛋白(spike protein,SP)、包膜蛋白(Envelope protein,EP)、膜蛋白(Membrane protein,M)和核衣殼蛋白(Nucleocapsid,NP)。

棘突蛋白(spike protein) 是冠狀病毒的表麵膜蛋白，含有兩個亞基（subunit）， S1和S2。其中S1主要包含有受體結合區（receptor binding domain， RBD），負責識別細胞的受體。S2含有膜融合過程所需的基本元件。

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      Spike 蛋白承擔病毒與宿主細胞膜受體結合及膜融合功能，是宿主中和抗體的重要作用位點以及疫苗設計的關鍵靶點。SARS-CoV-2 (2019-nCoV) 的Spike蛋白與人ACE2互作來感染人的呼吸道上皮細胞。

核衣殼蛋白是冠狀病毒中含量豐富的蛋白。在病毒體組裝過程中，N蛋白與病毒RNA結合並導致螺旋核衣殼的形成。核衣殼蛋白是一種高度免疫原性的磷蛋白，與病毒基因組複製和調節細胞信號通路有關。由於N蛋白的序列保守性和強大的免疫原性，N蛋白常被作為冠狀病毒診斷檢測工具。

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